顺应潮流：仅血浆ctDNA-MRD探测的应用前景！

"羧酸化被纳入MRD测定的潜能是明确的，期盼这些十分困难将继续提升更加早先MRD测定的机动功能性。"

肝癌的MRD测定是一种灵敏且特异的用于不确定功能性评核肝癌病征肠道中所源功能性遗传物质（如ctDNA）相对数量的工具。在这种状态下，病征没有人眼可见的肿瘤，但确实实际上常规药理学影像工具无法测定到但再度则会导致肝癌住院的极小肿瘤。

MRD，常称为极小移出肿瘤（Minimal Residual Disease）。一般来说“Minimal” （极小）这个词语，是因为它在文献和药理学研究专家中所更加都用。不过，“Minimal”这个词语可能则会不具备“误导功能性”，因为低低水平的肿瘤在结节病和病患决策方面也可能则会不具备最主要意涵。“Measurable”（可测算）一词语可更加可靠地描述移出在病人体内的细胞的实际上。NCCN指南同时一般来说了“Minimal Residual Disease”（极小移出肿瘤）和“Measurable Residual Disease”（可测算移出肿瘤）两个词语。

此外，可行功能性者表明在分子则会低水平上测定多种肝癌一般来说的ctDNA同样不具备药理学效用，文献和药理学研究专家有时也则会一般来说“Molecular Residual Disease”（分子则会移出肿瘤）一词语。

近年来，国内外在实体中所基于ctDNA的MRD评核（ctDNA-MRD）的药理学资料和显然越来越多，开启了实体瘤MRD测定的热潮。实体瘤ctDNA-MRD测定的新技术流派主要有两大类：

1）Tumor-informed assays（知情归纳）

对原发组合成织起来展开基因组以认定病征的特异基因组合成变异图谱，然后设计PCR订制panel或一般来说固定panel展开个功能性化的ctDNA测定归纳。

2）Tumor-uninformed assays（并不知道归纳）

也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays，即无需原发组合成织起来，大部分就其联一组合成预先选定PCR/探针设计的与肝癌一般来说就其的固定panel展开ctDNA测定归纳，常在测定ctDNA基因的同时，辅以ctDNA羧酸化或段落组合成学等多组合成学工具。弥补了组合成织起来样品不足或不确定功能性评核位点不足或TAT过长等情况。

Tumor-informed assays的新技术方式而更加符合受众的认知，在保证高抗原的必要下，可通过不确定功能性评核多位点的sample-level（样品低水平）进一步提升其敏感度，新技术门槛相对来说不是除此以外高。Tumor-uninformed assays的新技术方式而更加类似于更加早捻，通过提升site-level（位点低水平）测定敏感度并辅以ctDNA羧酸化或段落组合成学并合合机器学习算法进一步提升其敏感度和抗原，新技术门槛相对来说较高。

2021年4月底29日，《Clinical Cancer Research》在线登载了“大部分一般来说血清ctDNA测定合直肠癌病征极小移出肿瘤（MRD）”的文章，首次发布新闻了Guardant Reveal的深入研究资料：MRD测定敏感度达到91%，抗原达100%，这些找到支持了大部分血清ctDNA-MRD测定（Tumor-uninformed assays）的潜在药理学新技术的发展。

2021年8月底13日，《Clinical Cancer Research》在线登载了“顺应潮流：大部分血清ctDNA-MRD测定的新技术的发展前景”的文章，在这里深入研究者们讨论评核了大部分血清ctDNA测定MRD的战斗能力，以及将羧酸化定位到ctDNA测定的潜在用处。2

Parikh及其合作者1 和Taieb及其合作者3 讨论了大部分血清ctDNA-MRD测定在合直肠癌（CRC）病征中所的潜在药理学新技术的发展。

▲ ctDNA羧酸化和基因在两项深入研究中所的新技术的发展较为（Parikh和Taieb）

合直肠癌（CRC）的病患仍然陷入着一个挑战，即相当多的CRC病征因一时期哮喘住院而过更加早致死。尽管药理学采用了常规的专门设计病患，但高不确定功能性IIIC期CRC病征的5年生存率也大部分有53%，话虽如此是没有找到医学影像上未测定到的极小移出肿瘤（MRD）。4

目前，仍迫切必需可靠确定哪些病征术后实际上MRD，以帮助监督降低或增大专门设计病患，并增大治愈的可能则会功能性，同时最大限度地降低不必要病患的就其神经毒素。

在过去的几年里，我们对ctDNA在CRC诊断和结节病中所的新技术的发展有了广泛应用的了解。目前，基于ctDNA的MRD评核正广泛应用新技术的发展于肝癌的病患中所。

ctDNA是由DNA的短段落组合成成（至少130-150bp），由细胞通过细胞死亡、溃疡或分泌囚禁到循环系统中所。 ctDNA的氙较短骤然其踏入敏感的实时负载标志物，它的实际上可能则会体现了医学影像上看不见的微转移。

在治愈功能性病患合束后，ctDNA中所浮现的体细胞基因对随后的医学影像住院不具备较高的感染功能性得出结论商业化价值，除此以外是当这些基因与摘除的组合成织起来中所的基因相匹配时。测定这种ctDNA下定义的MRD可以在I-III期CRC中所延后医学影像数月底得出结论住院，从而为一组合成再度则会住院的CRC病征共享一个评核新疗法的站内。然而，这些ctDNA基础基因下定义的MRD测定工具的敏感度仍然是有限的，迫切必需改进其测定机动功能性。

ctDNA的羧酸化测定优于ctDNA的基础基因测定。ctDNA的羧酸化极度在CRC中所较为类似，并被看作大多数癌变的一时期阶段。这种羧酸化，具体下定义为DNA中所双链的C5位置添加羧酸基团，抑制邻近基因的表达，包括经典电影的畏凋亡失活。与基础基因相比，CRC中所实际上更加多的羧酸化极度区域，为提升MRD测定的敏感度共享了期望。SEPT9，就是第一个利用肠道测定单基因羧酸化极度展开捻查和一时期测定CRC的工具。尽管ctDNA羧酸化有这些优点，但这些相同的适应功能性也必需谨慎，以保持测定归纳的抗原，并可避免骗感染功能性的可能则会功能性。

在这种背景下，Parikh和Taieb的这两项最新深入研究合果为我们对ctDNA机动功能性的理解共享了有效率的补充，即无需原发组合成织起来，大部分通过肠道ctDNA羧酸化或联合ctDNA基因无需展开可靠的MRD评核。与其他必需对原发组合成织起来展开基因组以监督更加进一步ctDNA归纳的测定不尽相同，这两项深入研究探讨了Tumor-uninformed assays的实证，它有几个军事优势，包括短时间内的TAT，降低初始成本，对组合成织起来不足或不一般来说的病征展开不确定功能性评核。

Parikh等人共享了一种ctDNA羧酸化合合ctDNA基础基因的固定panel展开MRD的归纳评核（NGS工具），与其他商业化上一般来说的MRD测定工具相比，这种工具不必需摘除的组合成织起来以及订制化。在再度病患后一般来说时，这种大部分血清ctDNA-MRD测定对住院不具备药理学意涵的抗原（100%）和敏感度（55.6%），通过定位表观基因组合成特性和侧向不确定功能性评核归纳，其敏感度可进一步提升至91%。1 该工具被用于悄悄展开的基础功能性深入研究，包括监督IIA期合肠癌病患决策的NRG合作组合成深入研究（NCT04068103）。虽然还必需额外的资料集来验证这些找到，但这些合果显然了基于ctDNA的MRD测定在并不知道的情况下可接受的测定机动功能性特性。

Taieb等人的深入研究利用了一对先前被显然是CRC摘除后结节病就其的羧酸化基因标记物WIF1和NPY（ddPCR工具），并将它们新技术的发展于PRODIGE-GERCOR IDEA-France试验中，将III期CRC病征随机分为3个月底 vs 6个月底的专门设计化疗。在对参与III期试验中的III期CRC病征展开的首次ctDNA-MRD评核中所，有13.8%的病征术后为ctDNA-MRD感染功能性，并被证实为单独的结节病标志物。3 同时，深入研究者也指借助于，与其他采用NGS工具的ctDNA-MRD深入研究相比，本深入研究中所ctDNA的感染功能性率较差。敏感度和PPV同样低于NGS测定合果，ctDNA-MRD感染功能性和阴功能性的5年DFS则有65%和73%，尽管专门设计病患的和不期望的前归纳样品处理就则会对这些合果产生冲击。该工具都有的是其相对简单，较为差的成本和潜在的重现功能性，不必需商业化测定中所所见的专利申请测定工具。悄悄展开的基础功能性深入研究将进一步评核大部分血清ctDNA测定确实能够可靠评核MRD，以便对CRC病征展开不确定功能性分层，并监督专门设计病患决策。

无论采用何种工具，大部分用血清ctDNA-MRD测定来监督CRC病征的病患决定，必需可靠且可靠的测定工具。需进一步提升大部分血清ctDNA-MRD测定的敏感度来确定哪些病征可以从病患降级中所获益，以避免不恰当地选择高危病征接受较差气压的病患。Parikh及其合作者的深入研究合果表明，定位基因组合成和表观基因组合成以及侧向血清不确定功能性评核，可突借助于提升大部分血清ctDNA-MRD的敏感度。相比之下，ctDNA-MRD测定的高抗原对于ctDNA作为一个都有的生物学标志物来确定病患更新是至关最主要的。由于抗原不足，骗感染功能性的ctDNA-MRD就则会使病征接受不必要的弱化病患。Parikh及其合作者的深入研究合果显然，除基础基因外，还可以通过合合表观基因组合成羧酸化特性的归纳来保持抗原。Taieb等人的归纳工具的军事优势在于提升了药理学特性的敏感度和结节病，但是，正如深入研究者否认的那样，单独的两个基因羧酸化标记可能则会无法共享与合合基础基因工具的机动功能性特性。最主要的是，这项岗位也忽略了常规化归纳前条件的最主要功能性，因为各种提取工具可以在很大程度上冲击ctDNA的得率和都有功能性。在今后的深入研究中所，这些归纳前的考虑将变得越来越最主要。

羧酸化被纳入MRD测定的潜能是明确的，期盼这些十分困难将继续提升更加早先MRD测定的机动功能性。总之，大部分血清ctDNA-MRD的测定共享了一个独特的期望，一般来说一种无创工具来探索病患方案，并有可能则会发挥作用高危病征的微前列腺癌肿瘤。这些深入研究合果无疑为今后ctDNA-MRD监督的基础功能性药理学实验坚持不懈了道路。

MRD，仍然是一个短时间内发展的领域，我们预计近两年就则会浮现重新显然，要么显示借助于MRD测定的药理学效用的局限功能性，要么显示借助于MRD测定的其他军事优势和新用途。

参考资料：

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.